基于微生物的特征性标签序列,进行扩增子测序,在环境微生物群落结构研究中扮演着重要的角色。微生物多样性研究动态报告,借助标签序列PCR扩增及多样性分析方法,可以对微生物基因组特征区域(如16s rRNA 高变区等)进行测序,并开展物种鉴定。可以帮助科研工作者快速确定群落物种,探索特征性菌谱或进一步研究微生物的特定功能基因。
l OTU聚类及分类学注释
基于高标准的数据质控及Merge,进行多样本OTU聚类,根据序列差异进行物种分类,快速高效进行样本的物种注释及丰度统计,揭示样本中微生物群落构成。
l 多样性指数分析
结合α多样性及β多样性分析,从不同视角解析微生物群落构成特点,探讨不同样本间微生物群落的异质性
l 种群结构分析
多种分析手段直观展现各个样本的群落结构及微生物丰度信息。
l 差异分析
多元化比较,探索不同样本的显著性差异及根源,帮助解释科学研究中的差异性
问题
l 关联分析
将环境样本和微生物,微生物和微生物,环境因子与微生物……之间的关系进行关联,探索群落结构形成的机制和背景原因。
l ……
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