Filter LEFSe result(过滤LEfSe结果)

分析模块根据LEfSe分析结果中第一列进行关键字过滤。如果第一列字符串与设置的关键字匹配,则该行会被过滤。

输入:

LEfSe分析结果文件,由分析模块 "LDA Effect Size (LEfSe) Analysis" 生成。

示例:

Bacteria.Proteobacteria.Deltaproteobacteria.Other.Other  0.0                      -

Bacteria.Proteobacteria.Gammaproteobacteria.Alteromonadales.Alteromonadaceae.Microbulbifer         0.0                      -

Bacteria.Firmicutes.Bacilli.Lactobacillales.Streptococcaceae    0.0                      0.0209213353378

Bacteria.Proteobacteria.Alphaproteobacteria.Rhodospirillales.Acetobacteraceae.Asaia   0.0                      -

设置过滤关键字为:

输出:

过滤后的LEfSe分析结果:

Bacteria.Proteobacteria.Gammaproteobacteria.Alteromonadales.Alteromonadaceae.Microbulbifer         0.0                      -

Bacteria.Firmicutes.Bacilli.Lactobacillales.Streptococcaceae    0.0                      0.0209213353378

Bacteria.Proteobacteria.Alphaproteobacteria.Rhodospirillales.Acetobacteraceae.Asaia   0.0