Select top N highest abundance rows in OTU/Taxon T

分析模块对每个OTU在所有样品中的丰度信息进行求和,输出丰度信息求和最高的OTU信息。

输入:

OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0      0       0       0       0      6     34    104  367   254

OTU2        52   335   18     49      0      0      0      0      0      0

OTU3        0       0      0       0       5      0      0      0      0      0

设置参数,选择输出所有样品中,丰度信息求和最高的前20Top 20)。

输出:

丰度求和Top 20OTU Table文件(由大到小排序):

OTU ID     Bio1   Bio2   Bio3   Bio4    Bio5   Bio6  Bio7   Bio8    Bio9   Bio10

OTU251   3209   3731  7070  4750    1993  482   96      749     4696   5951

OTU956   1967   204    79      671      12      76     2609  18370 3899   524

OTU932   13       24      125    10        1934  106   118     966    9766   3589

OTU524   36       778    292    11319  12      12     159     81      1864   362

OTU1053 2715   502    199    387       8       90     8733   417    644     128