Get a sub-OTU Table(生成OTU子表)

分析模块根据样品分组信息表中第一列对应的样品信息,抽取输入的OTU Table中对应的样品丰度信息,生成一个只包含这些样品的子OTU Table。通常,对于第二个文件输入参数而言,只要第一列包含所需的样品名信息,就可以作为输入文件。

输入:

OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0       0       0       0       0       6       34     104  367  254

OTU2        52     335  18     49     0       0       0       0       0       0

OTU3        0       0       0       0       5       0       0       0       0       0

样品分组信息表:

Bio1 group1

Bio2 group1

Bio3 group1

Bio4 group2

Bio5 group2

其他参数默认。

输出:

对应生成的子OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5

OTU2        52     335  18     49     0

OTU3        0       0       0       0       5

OTU4        12     14     0       16     0

OTU5        2       0       0       0       0

OTU6        2       2       13     2       1

还可以使用以下方式生成OTU Table子表:

1、在文件浏览器中,选中对应的OTU Table文件。

2、点击右键菜单New -> subSet OTU Table,弹出子表样本信息设置窗口。

3、选择对应的样本,点击OK按钮得到对应的OTU Table子表信息文件。