Normalize the OTU Table(标准化OTU Table)

分析模块将OTU Table中样品的OTU序列数进行均一化,使得每个样品的OTU序列数求和一致。均一化的数值设为1,则为相对丰度值。在处理过程中,每个样本只是简单的根据相对丰度进行等比例的放大和缩小。建议使用高级分析中的抽平模块("Creates a subsampled OTU table by random sampling of the absolute abundance OTU table"),进行随机抽样,生成样本序列数一致的OTU Table。


输入:


OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0       0       0       0       0       6       34     104  367  254

OTU2        52     335  18     49     0       0       0       0       0       0

OTU3        0       0       0       0       5       0       0       0       0       0


设置参数:

所有样本均一化为1000


输出:


每个样本单独均一化后的OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0       0       0       0       0       0.200113397591969        1.39498625528248 2.89524233735141 9.07091129291381         8.1658897283395

OTU2        1.30791287288093 10.4625378681408 0.581564408258215        1.29609056763477 0       0       0       0       0       0

OTU3        0       0       0       0       0.166777851901268        0       0       0       0       0

OTU4        0.301826047587907        0.437240388519317        0       0.423213246574618        0       0       0       0       0       0