String Annotation with BLAST+ blastp/blastx(String
String Annotation with BLAST+ blastp/blastx(String

功能简介

分析模块,利用blastp/blastx程序,输入Fasta格式的蛋白/核酸序列文件,与String数据库进行比对,输出String数据库注释结果。


分析模块,引用了 ncbi-blast-2.2.31+ 软件(ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.31/)

相关文献如下所示:

Camacho, Christiam and Coulouris, George and Avagyan, Vahram and Ma, Ning and Papadopoulos, Jason and Bealer, Kevin and Madden, Thomas L (2009). BLAST+: architecture and applications. In BMC Bioinformatics, 10 (1), pp. 421.