Filter VCF File V2(V2版本过滤VCF文件)

分析模块,输入vcf格式的变异信息文件,根据INFO中用户自定义的字段,对变异结果进行过滤。

关于VCF格式的详细介绍,参考:(http://www.1000genomes.org/wiki/Analysis/variant-call-format/)。


输入:


vcf格式的变异信息文件。


输出:


经过过滤后的vcf文件。


Input the field name in INFO column and will use it to filter the Vcf file:输入INFO信息中的字段名,如DP、AC、AF等。

The Minimum cutoff of specified field:输入对应字段的最大值,对应字段大于这个值的变异结果将会被过滤。

The Maximum cutoff of specified field:输入对应字段的最小值,对应字段小于这个值的变异结果将会被过滤。