BSA混池测序数据分析

下图展示了BSA分析流程,输入两个样品的SNP变异信息VCF文件,可通过比对和变异检测分析流程获得。接着,计算显性性状混池和隐性性状混池的SNP-Index信息,对混池间SNP-Index的差值进行LOESS回归,挑选bootstrap后显著差异的区间作为目标性状区域。最后,对候选区间的变异信息进行注释。