Summary KEGG Enrichment(统计KEGG富集结果)

分析模块,输入差异基因KEGG富集分析HTML结果文件(链接所有KEGG富集分析的结果),得到样品或分组间的富集检验p值分布表。


输入:


差异基因KEGG富集分析HTML文件(链接所有KEGG富集分析的结果),由分析模块“Batch Mode: KEGG Enrichment Analysis”生成。

示例:


输出:


样品或分组间的富集检验p值分布表。

示例:

        T4_vs_T5         T4_vs_T6         T4_vs_T7         T4_vs_T8         T4_vs_T9         T5_vs_T6         T5_vs_T7         T5_vs_T8         T5_vs_T9         T6_vs_T7         T6_vs_T8         T6_vs_T9         T7_vs_T8         T7_vs_T9         T8_vs_T9

ko00450 Selenocompound metabolism    1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       0.0474209796274

ko00240 Pyrimidine metabolism       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       0.0401878042391

ko00410 beta-Alanine metabolism   1       1       1       1       0.0258385115652    1       1       1       0.0258385115652    1       1         0.0258385115652    1       1       1

ko00910 Nitrogen metabolism 1       1       1       0.0404766837162    1       1       1       1       1       1       0.0412839985471    1         0.00760136411042 1       1

ko00220 Arginine biosynthesis 1       1       1       1       1       1       0.033502338074      1       1       0.033502338074      1       1       1       1         1

……

注:行代表ko号,即代谢通路名称,列代表具体的样品或分组比较。数值表示富集分析中,对应ko通路进行检验的p值。如果在某个比较中,输出的KEGG_enrich文件中,定位不到对应的ko号,则检验p值用1表示。

在分析模块“Batch Mode: KEGG Enrichment Analysis”中,默认输出p小于0.05的结果,建议设为1。然后,利用本分析模块进行统计。


后续,可以利用分析模块“Make Distance HeatMap”对结果进行可视化展示。

示例: