Batch Mode: Plot GO Enrichment(批处理:GO富集散点图)

分析模块,输入差异基因GO富集分析HTML结果文件(链接所有GO富集分析的结果),由分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”生成,输出GO富集散点图HTML结果文件(链接所有的GO富集散点图)。

模块为分析模块“Plot GO Enrichment”的批处理版本,对输入HTML文件中包含的链接文件进行批处理,输出相应处理后的HTML结果文件(链接批处理后的文件)。


输入:


差异基因GO富集分析HTML文件(链接所有GO富集分析的结果),由分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”生成。

示例:


输出:


GO富集散点图HTML文件(链接所有的GO富集散点图,只针对“ e ”,显著富集的结果进行作图)。

示例:


关于HTML链接的文件内容和格式。

*.GO_enrich文件参考分析模块“GO Enrichment Analysis”的帮助文档。

*.GO_enrich.pdf文件参考分析模块“Plot GO Enrichment”的帮助文档。



分析模块引用R语言(v3.2.1)ggplot2包(v2.2.1)中的geom_point相关功能进行GO富集散点图的绘制。