Summary GO Enrichment(统计GO富集结果)

分析模块,输入差异基因GO富集分析HTML结果文件(链接所有GO富集分析的结果),得到样品或分组间的富集检验p值分布表。


输入:


差异基因GO富集分析HTML文件(链接所有GO富集分析的结果),由分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”生成。

示例:


输出:


样品或分组间的富集检验p值分布表。

示例:

        T4_vs_T5         T4_vs_T6         T4_vs_T7         T4_vs_T8         T4_vs_T9         T5_vs_T6         T5_vs_T7         T5_vs_T8         T5_vs_T9         T6_vs_T7         T6_vs_T8         T6_vs_T9         T7_vs_T8         T7_vs_T9         T8_vs_T9

GO:0005575 cellular_component     1       1       0.00302    1       1       1       0.0453      0.0158      1       0.0234      1       1       0.00126    1         1

GO:0000990 transcription factor activity, core RNA polymerase binding  1       1       1       0.0392      1       1       1       0.00511    1       1         0.0063      1       1       1       1

GO:1901564 organonitrogen compound metabolic process      1       1       1.07e-05   1       1       1       0.00681    0.0416      1       0.00032         1       1       0.0225      1       1

GO:1990748 cellular detoxification  1       1       1       0.0441      1       1       1       0.0417      1       1       0.0457      1       1       1       1

GO:0048037 cofactor binding  1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       0.048        1       1       1

GO:0055114 oxidation-reduction process          1       1       0.0262      1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1

……

注:行代表GO Term,列代表具体的样品或分组比较。数值表示富集分析中,对应GO进行Fisher精确检验的p值。如果在某个比较中,输出的GO_enrich文件中,定位不到对应的GO Term,则检验p值用1表示。

在分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”中,默认输出p小于0.05的结果,建议设为1。然后,利用本分析模块进行统计。


后续,可以利用分析模块“Make Distance HeatMap”对结果进行可视化展示。

示例: