Matrix to gene plots(单个基因表达水平折线图)

分析模块,输入FPKM矩阵,以折线图或柱状图的形式展示每个基因在每个样品中的表达量情况。

输入:

FPKM矩阵(FPKM Matrix)。

示例:

        T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         390.11      379.54      386.52      288.73      372.47      327.73

BM590_A0002         350.06      310.51      328.78      175.32      249.21      210.62

BM590_A0003         222.52      219.54      209.39      174.45      97.20        240.38

BM590_A0004         406.46      494.13      414.62      825.09      2678.41    555.67

BM590_A0005         605.70      755.09      643.55      1184.73    2980.14    568.58

BM590_A0006         306.72      311.16      351.08      282.26      204.19      310.56

……

输出:

每个基因表达量折线图或柱状图。

示例:

注:标题为基因名称,横坐标为样本名称,纵坐标为对应基因的表达量信息。

分析模块引用R语言(v3.2.1)进行计算和绘图。