FPKM Scatterplot for two samples(两样品间FPKM散点图)

分析模块,输入FPKM矩阵,绘制指定两个样品的FPKM散点图

输入:

FPKM矩阵(FPKM Matrix)。

示例:

        T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         390.11      379.54      386.52      288.73      372.47      327.73

BM590_A0002         350.06      310.51      328.78      175.32      249.21      210.62

BM590_A0003         222.52      219.54      209.39      174.45      97.20        240.38

BM590_A0004         406.46      494.13      414.62      825.09      2678.41    555.67

BM590_A0005         605.70      755.09      643.55      1184.73    2980.14    568.58

BM590_A0006         306.72      311.16      351.08      282.26      204.19      310.56

……

设置:

Choose Sample in FPKM matrix in numerical column, for X-axis2,列对应样本T4

Choose Sample in FPKM matrix in numerical column, for Y-axis3,列对应样本T5

输出:

对应两个样品的FPKM散点图。

示例:

注:每个点代表一个基因,横纵坐标为对应样品的log2fpkm+1)值。左图,添加了一元线性回归拟合直线。r为两个样本间的皮尔逊相关系数。

分析模块引用R语言(v3.2.1)中的plot函数进行图形的绘制。