Batch Mode: Filter DE Analysis Result(批处理:过滤差异表达分析

分析模块,输入差异表达分析HTML结果文件,可由分析模块“Differential Expression Analysis”和“Parse Cuffdiff results”生成。根据pval、FDR/padj、logfc,批量过滤输入HTML文件链接的所有差异表达分析结果,得到过滤后的HTML结果文件(链接所有过滤后的差异结果)。支持批量处理edgeR、DESeq2、limma、Cuffdiff的HTML分析结果。

模块为分析模块“Filter DE Analysis Result”的批处理版本,对输入HTML文件中包含的链接文件进行批处理,输出相应处理后的HTML结果文件(链接批处理后的文件)。


输入:


差异表达分析HTML结果文件,可由分析模块“Differential Expression Analysis”和“Parse Cuffdiff results”生成。

示例(edgeR):



输出:


1、过滤后的差异表达结果HTML文件(链接所有过滤后的差异结果)。

示例(edgeR):



2、过滤后的差异表达上调结果HTML文件(链接所有过滤后的上调差异结果)。

示例(edgeR):



3、过滤后的差异表达上调结果HTML文件(链接所有过滤后的下调差异结果)。

示例(edgeR):




关于HTML链接的文件内容和格式。

*.DE_results文件参考分析模块“Differential Expression Analysis”、“Parse Cuffdiff results”的帮助文档。

*.Fi文件参考分析模块“Filter DE Analysis Result”的帮助文档。