Generate sample group file from file header(生成分组文件

分析模块,根据输入制表符分隔文本文件的表头信息,生成对应的样品分组信息文件。

输入:

制表符分隔的文本文件(如Count矩阵、FPKM矩阵等)。

示例:

         T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         565  505  843  286  247  1909

BM590_A0002         362  295  512  124  118  876

BM590_A0003         235  213  333  126  47     1021

BM590_A0004         291  325  447  404  878  1600

BM590_A0005         530  607  848  709  1194         2001

BM590_A0006         456  425  786  287  139  1857

……

设置参数:

分组:Group Namegroup1Column Range2-3,4

分组:Group Namegroup2Column Range5-6

输出:

样品分组信息文件。

示例:

T4     group1

T5     group1

T6     group1

T7     group2

T8     group2

!!建议使用以下方式生成样本分组信息文件:

1、在文件浏览器中,选中对应的矩阵文件。

2、点击右键菜单New -> Sample Group File,弹出设置样本分组信息窗口。

或者在项目编辑窗口中,选中矩阵输入文件,点击右键菜单 Get group design file from tabular file.,弹出设置样本分组信息窗口。

!!注:文件格式必须是tabular,可通过Reset Format进行文件格式的更改。

3、设置分组信息,点击OK按钮得到对应的样本分组信息文件。