转录组分析数据库整理

每个物种,由以下数据信息组成:

     *.cds.all.fasta

     参考转录本序列(CDS)

     *.gene_trans_map.txt

     基因ID与转录本ID对应关系表

     *.GO_Anno.txt

     GO注释信息文件

     *.KEGG_Anno.txt

     KEGG注释信息文件

*数据信息来源:Ensemble官网,KEGG官网,Gene Ontology官网。

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各物种数据列表:

     人类(hg19,GRCh37)

     http://pan.baidu.com/s/1eRXmeP0

     小鼠(Mus musclus,GRCm38)

     http://pan.baidu.com/s/1kVfPs39

     大鼠(Rattus norvegicus,Rnor_6.0)

     http://pan.baidu.com/s/1dFjzz8l

     斑马鱼(Danio rerio,GRCz10)

     http://pan.baidu.com/s/1eSLXb5w

     鸡(Gallus gallus,Galgal4)

     http://pan.baidu.com/s/1c155OrA

     猪(Sus scrofa,Sscrofa10.2)

     http://pan.baidu.com/s/1o8LaJii

     牛(Bos taurus,UMD3.1)

     http://pan.baidu.com/s/1pKUlT6F

     羊(Ovis aries,Oar_v3.1)

     http://pan.baidu.com/s/1pKA9d7H

     酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae,R64-1-1,2011-11-SGD)

     http://pan.baidu.com/s/1boGxl2v

     粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe,ASM294v2,Chadov56)

     http://pan.baidu.com/s/1mibJ7O8

     水稻(Oryza sativa,IRGSP-1.0)

     http://pan.baidu.com/s/1dFzEyFB

     拟南芥(Arabidopsis thaliana,TAIR10)

     http://pan.baidu.com/s/1skJY1u1

     玉米(Zea mays,AGPv4,CampbellMaker2015Dec)

     http://pan.baidu.com/s/1nvk5jXR

     小立碗藓(Physcomitrella patens,ASM242v1,2011-03-Phypa1.6)

     http://pan.baidu.com/s/1misEFYK

     小麦(Triticum aestivum,TGACv1)

     http://pan.baidu.com/s/1i5fUPoh

     番茄(Solanum lycopersicum,SL2.50)

     http://pan.baidu.com/s/1jI3BvvS

     大豆(Glycine max,JGI-Glyma-1.1)

     http://pan.baidu.com/s/1gfkHzMj