Plot Venn Diagram(维恩图分析v1)

Venn图可用于统计多个样本中所共有和独有的OTU数目,可以比较直观的表现环境样本的OTU数目组成相似性及重叠情况。通常情况下,分析时,输入OTU样本表,通过进一步对共有及独有OTU分类信息进行统计作图,深入比较样本间相似性及差异性。


输入:

OTU Table文件:

OTU ID    Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0       0       0       0       0       6       34     104  367  254

OTU2        52     335  18     49     0       0       0       0       0       0

OTU3        0       0       0       0       5       0       0       0       0       0

设置样品Bio1、Bio2、Bio3、Bio4、Bio5,那么就需要设置输入对应的列数信息,以逗号分隔。

其他参数默认。


输出:

Venn图:

注:不同样品用不同颜色标记,各个数字代表了某个样品独有或几种样品共有的OTU 数量。样本分组至少2个,最多5个。


相关文献如下所示:

Fouts DE, Szpakowski S, Purushe J, Torralba M, Waterman RC, et al. (2012) Next Generation Sequencing to Define Prokaryotic and Fungal Diversity in the Bovine Rumen. PLoS ONE 7(11): e48289. doi:10.1371/journal.pone.0048289.