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转录组软件
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细菌基因组软件
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  PCOA分析
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  样本聚类树与柱状图组合分析
  群落Heatmap图
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  LEFSE分析
  Plsda分析
  多样品分类学系统组成树
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(un)WeightedUniFrac分析
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  样本距离heatmap图
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  原始数据统计
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  表达量计算(Transcripts-Based Analysis)
  差异表达分析
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  PCA分析
  子表达模式分析(时序、发育)
  PCOA分析
  样品hclust聚类树状图
  相关性系数分析
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  FPKM箱线图
  样本距离分析
  FPKM分布图
  差异基因调控网络图
  差异基因子表达模式网络图
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  GO有向无环图
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  GO富集散点图
  GO富集分析
  GO富集柱状图
  KEGG富集分析
  KEGG富集散点图
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  可变剪切分析
  indel分析
  SNP分析
  表达量计算(Reference and Annotation Based Analysis)


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  原始数据质控
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  原始数据比对
  去除PCR-Duplication
  SNP突变检测
  InDel突变检测
  SNP突变注释
  InDel突变注释
  SNP-Index计算(窗口基于物理距离)
  SNP-Index计算(窗口基于SNP数目)
  SNP-Index分布图
  性状关联目标区域筛选(基于SNP-Index计算结果)
  靶向区域序列提取
  靶向区域深度覆盖度计算
  靶向区域SNP、InDel结果坐标还原
  原始测序数据预处理
  靶向区域测序数据分析
  BSA混池测序数据分析
软件功能介绍
  原始数据质控
  原始数据统计
  基因组大小评估(kmer分析)
  基因组组装
  组装结果评估(GC Depth)
  rRNA/tRNA 查找      
  基因预测
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