上海盈飞生物科技有限公司

重测序分析模块一览

★ 重测序分析模块


原始数据质控	原始数据统计

SE数据质量剪切	PE数据质量剪切

原始数据比对	去除PCR-Duplication

SNP突变检测	InDel突变检测

SNP突变注释	InDel突变注释

★ BSA分析扩展

　‍‍SNP-Index计算（窗口基于物理距离）

　‍‍SNP-Index计算（窗口基于SNP数目）

　‍‍SNP-Index分布图

　‍性状关联目标区域筛选（基于SNP-Index计算结果）

★ 靶向区域（Panel）测序数据分析扩展

　‍靶向区域序列提取

　‍靶向区域深度覆盖度计算

　‍靶向区域SNP、InDel结果坐标还原