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分析模块，输入KEGG注释信息文件，统计注释到通路（ko）中，对应的基因信息，输出统计结果。 ！！对于主要物种，软件团队从KEGG网站上，下载并整理了对应物种的KEGG注释信息。访问，VG软件官方网站：（http://www.vgenomics.cn/），进行下载。 输入： KEGG注释信息文件，其中，第一列为基因名，第二列为对应的K号。Kddddd表示，在所有同源物种中具有相似结构和功能的一类同源蛋白。如K04456表示丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 示例： BM590_A0001 K02313 BM590_A0003 K03629 BM590_A0005 K12972 BM590_A0006 K13896 BM590_A0007 K13895 …… 输出： 通路（ko）中基因信息统计结果。 示例： #Term Database ID Number Input Hyperlink Pantothenate and CoA biosynthesis KEGG PATHWAY ko00770 9 BM590_A0097|BM590_A2072|BM590_A0677|BM590_A0358|BM590_A2054|BM590_A0310|BM590_A1382|BM590_B0909|BM590_A0357 http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?ko00770/K17723%09red/K00997%09red/K00859%09red/K00053%09red/K01687%09red/K00606%09red/K01918%09red/K00867%09red RNA degradation KEGG PATHWAY ko03018 9 BM590_A0760|BM590_A2048|BM590_A2114|BM590_A1110|BM590_A0920|BM590_A1548|BM590_A1826|BM590_A1050|BM590_A0827 http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?ko03018/K08311%09red/K00970%09red/K08300%09red/K11927%09red/K03666%09red/K03628%09red/K12574%09red/K00937%09red/K04043%09red beta-Alanine metabolism KEGG PATHWAY ko00410 9 BM590_B0872|BM590_B0990|BM590_B0759|BM590_B0890|BM590_B0891|BM590_A0217|BM590_B0640|BM590_A0310|BM590_A0357 http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?ko00410/K00128%09red/K17723%09red/K01918%09red/K01782%09red/K00822%09red …… 注： 其中，每一列的含义如下所示： l #Term，代谢通路描述。 l Database ，数据库类型。 l ID，ko号，代谢通路名称，表示一个特定的生物路径。 l Number，该通路中的基因个数。 l Input，对应的具体基因，以“ | ”符号分隔。 l Hyperlink，超链接，链接到KEGG官网上对应的代谢通路图。 分析模块引用了KOBAS（v2.0-20150126）软件（http://kobas.cbi.pku.edu.cn）。 相关文献如下所示： Xie, C., Mao, X., Huang, J., Ding, Y., Wu, J., Dong, S., Kong, L., Gao, G., Li, C. and Wei, L. (2011) KOBAS 2.0: a web server for annotation and identification of enriched pathways and diseases. Nucleic Acids Res, 39, W316-322. KEGG 库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes 数据库)：京都基因和基因组百科全书，是系统分析基因功能、联系基因组信息和功能信息的知识库。利用KEGG数据库，可将基因按照参与的pathway通路或行使的功能分类。 ！！更新KOBAS程序后台的KEGG数据库，通过KOBAS官网链接（http://kobas.cbi.pku.edu.cn/），下载最新的ko.db.gz文件，解压后覆盖软件根目录database文件夹下的同名文件。
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