分析模块根据,PCA或PCOA分析的位置结果(sites文件),可由分析模块“PCA analysis and plot PCA”或“PCOA analysis and plot PCOA”生成,进行PCA或PCOA结果的3D可视化展示。 输入: PCA或PCOA位置结果(sites文件)。 示例: "PC1" "PC2" "PC3" "PC4" "PC5" "Bio1" -1039.68 3247.136 717.972 830.5189 "Bio2" -2966.98 1212.454 799.9831 1572.571 "Bio3" -3846.78 -333.115 -714.098 5614.498 "Bio4" -4065.41 -5355.16 8227.647 -1730.08 "Bio5" -2416.51 1166.944 -1828.84 -242.264 "Bio6" -2196.88 3398.365 -636.104 -398.777 "Bio7" 1215.424 5804.67 585.3508 -4860.12 "Bio8" 17033.77 -736.864 1445.149 1692.697 "Bio9" 808.4387 -6455.45 -5709.28 -3165.87 "Bio10" -2525.39 -1948.98 -2887.78 686.823 样品分组信息表(可选)。 示例: Bio1 group1 Bio2 group1 Bio3 group1 Bio4 group2 Bio5 group2 Bio6 group2 Bio8 group3 Bio10 group3 - 输出: PCA或PCOA的3D可视化图。 示例: 注:当用户选择输入分组文件时,可以设置两个参数: 第一个为legend的相对水平偏移量,默认值为-0.05,负值代表往右偏移,正值则相反 第二个为legend的相对垂直偏移量,默认值为0,同样,可以设置正值或者负值,负值代表垂直向上偏移,正值则相反 分析模块引用R语言(v3.2.1)scatterplot3d包(v0.3-37)中的scatterplot3d函数进行可视化作图。
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