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I. 表达量计算（Transcripts Based）

  • Build Transcript Reference Index（构建转录本参考索引）

  • RSEM: Align and Estimate Abundance（RSEM方法比对和表达量计算）

  • eXpress: Align and Estimate Abundance（eXpress方法比对和表达量计算）

  • merge RSEM estimates（合并多个样品RSEM表达量计算结果，得到count和fpkm矩阵）

  • merge eXpress estimates（合并多个样品eXpress表达量计算结果，得到count和fpkm矩阵）
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