分析模块对样品的分类学和丰度信息进行Krona饼图展示。输入文件为分析模块"Summary the representation of taxonomic groups"产生的带有Rank信息结果文件。

输入：

带有Rank信息的Taxon Table文件：

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

d__Bacteria;Unclassified;Unclassified;Unclassified;Unclassified;Unclassified 33.0 29.0 1.0    12.0 44.0 5.0    141.0        100.0         10.0 3.0

d__Bacteria;p__Acidobacteria;c__Acidobacteria;o__Acidobacteriales;f__Acidobacteriaceae_(Subgroup_1);g__Terriglobus 1.0    3.0         7.0    28.0 0.0    0.0    0.0    0.0    0.0    0.0

d__Bacteria;p__Acidobacteria;c__Acidobacteria;o__Acidobacteriales;f__Acidobacteriaceae_(Subgroup_1);g__uncultured 4.0    1.0         3.0    0.0    0.0    0.0    0.0    0.0    0.0    0.0

d__Bacteria;p__Acidobacteria;c__Acidobacteria;o__Subgroup_10;Unclassified;Unclassified         0.0    0.0    0.0    0.0    14.0 81.0 0.0         0.0    0.0    0.0

d__Bacteria;p__Acidobacteria;c__Acidobacteria;o__Subgroup_10;f__ABS-19;g__norank   0.0    0.0    0.0    0.0    6.0    16.0 43.0 0.0         2.0    1.0

输出：

图. Krona Pie Chart

注意：生成的结果为HTML5格式文件，需要支持相关功能的浏览器才能打开。支持的浏览器列表如下所示：

分析模块引用了KronaTools-2.6.1的ktImportText命令。

相关文献如下所示：

Interactive metagenomic visualization in a Web browser, Brian D Ondov, Nicholas H Bergman and Adam M Phillippy, BMC Bioinformatics201112:385, DOI: 10.1186/1471-2105-12-385